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Bioingegneria cellula 2022/23 Temi d’esame Domande esame orale – a.a. 2022/23 Martedì 17 gennaio 2023 • Strutturazione del DNA: cromatina • Come si apre per rendere accessibile la doppia elica? Considerando che il DNA ha carica complessivamente negativa e le proteine istoniche hanno carica complessivamente positiva, per aprire la struttura il controllo si esplica attraverso: o H1: fosforilazione (aggiunta gruppo fosfato -𝑃𝑂567 negativo) à la proteina cambia conformazione e modifica la sua interazione, infatti, essendo il DNA negativo, l’aggiunta di un gruppo fosfato negativo riduce l’affinità (repulsione elettrostatica) di H1 con il DNA linker. o Istoni del nucleosoma: acetilazione (aggiunta gruppo -𝐶𝐻6𝐶𝑂7) o metilazione (aggiunta gruppo -𝐶𝐻6) à nell’istone H4, i residui di serina e lisina hanno cariche positive, la loro acetilazione riduce l’interazione elettrostatica con il filamento di DNA avvolto e permette l’accesso delle DNA polimerasi e altri fattori di trascrizione • Polimerizzazione dei mt distinguendo il caso in vivo e in vitro. Differenza: fase di nucleazione (assente in vivo per la presenza del centrosoma) à cambia la velocità di crescita iniziale. Rivedi il grafico di crescita-decrescita-crescita (instabilità dinamica) • Struttura mt 13:3, poi fare con N = 12 e calcolare sia l’angolo teta che il passo del superavvolgimento che si crea. La giunzione ha sempre contatto eterologo beta-alfa o alfa-beta, invece, i contatti laterali sono sempre alfa-alfa o beta-beta. • Effetto del colesterolo in generale sulla membrana (stress: in funzione della temperatura à a bassa e a alta T) facendo capire cosa influenza e in che direzione la sua presenza. Disegnare la sua struttura nella membrana. La testa polare del colesterolo con cosa interagisce? Accede all’ambiente…