Completed notes of the course

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CODING GENES Le sequenze del genoma sono messe a disposizione in banche date pubbliche e sono a disposizione della comunità scientifica. Le banche dati primarie sono: 1. Banca dati Europea (EMBL) 2. Banca Dati Statunitense (GENBANK) 3. Banca dati Giapponese (DOBJ) Si tratta di banche dati equivalenti dal punto di vista del contenuto perché l’aggiornamento è continuo, quindi le differenze sono sulle specificità dei singoli database . In esse troviamo sequenze del genoma umano ma anche di altre specie. PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION I geni che codificano proteine hanno un prodotto proteico, cioè una molecola che si forma per traduzione di una sequenza di nucleotidi. La sequenza di amminoacidi ricavata viene detta struttura primaria (successione di amminoacidi). Abbiamo poi la struttura secondaria che si riferisce a conformazioni strutturali di base (alpha eliche filamenti beta, che sono i costituenti fondamentali del folding finale cioè della struttura terziaria che è la struttura più complessa della proteina. La tradu zione di due sequenze geniche che si complessano tra loro danno vita alla struttura quaternaria. Le proteine sono da sempre identificate come le molecole che realizzano le operazioni necessarie all’intero della cellula, infatti abbiamo proteine che si occupano di rendere possibili le reazioni, proteine di trasporto, proteine di canale (stanno sulla membrana e permettono il passaggio di ioni). Questo non vuol dire che guardiamo alle proteine solo come scopo finale ma guardiamo i geni come sono fatti nella lo ro anatomia, guardiamo l’RNA, guardiamo tutti gli elementi di modulazione che intervengono per la regolazione (aspetto fondamentale per la comprensione dei meccanismi fisiologici e patologici). N.B. Si parla di diverse omiche che attengono ai diversi…