Laboraty of R complete notes

Page 1

APPUNTI R (BDA PRIMA PARTE) LS 1 INDICE: Primo laboratorio: introduzione ad R → 3 Secondo laboratorio: esplorazione multivariata, anova e pca → 5 Terzo laboratorio: Pca e regressione lineare → 17 Quarto laboratorio: regressione lineare → 29 Quinto laboratorio: cross validazione e shrinkage → 37 Sesto laboratorio: regressione logistica, LDA, QDA e KNN → 43 Settimo laboratorio: alberi di regressione e alberi di classificazione → 58 Ottavo laboratorio: random forest e k-means→ 69 Nono laboratorio: clustering gerarchico→ 78 Esercizi aggiuntivi: 83 2 PRIMO LABORATORIO: INTRODUZIONE AD R → Tipi base di algebra: Per creare un vettore si utilizza la funzione c, che permette di unire più valori in modo da creare un vettore per esempio: v1 = c(0.5, 1, 2, 4, 6). La funzione length permette di vedere quanto è lungo il vettore considerato, length (v1) Si può andare ad estrarre da degli oggetti ciò che è in determinate posizioni usando le parentesi quadre [ ]: •Se voglio il primo elemento di v1: v1[1] •Dal primo al terzo elemento di v1: v1[1:3] •Primo, terzo e quinto elemento di v1: v1[c(1,3,5)] •Tutti gli elementi tranne il primo di v1: v1[-1] •Tutti gli elementi tranne il primo, il terzo e il quinto di v1: v1[-c(1,3,5)] Per scrivere le matrici ci sono diversi modi a disposizione: Si può specificare colonna per colonna con cbind m1 = cbind(c(1,2,3), c(4,5,6), c(7,8,9)) Si può specificare riga per riga con rbind m2 = rbind(c(1,2,3), c(4,5,6), c(7,8,9)) Oppure si può usare la funzione matrix: m3 = matrix (data = (1,2,3), nrow = 10, col = 4, byrow= ’T’) cosi facendo si creerà una matrice 4 x 10, composta solo da 1,2,3 e dicendo byrow = T, indico che deve riempirla per riga. Anche per estrarre degli elementi dalla matrice si utilizzano le parentesi quadre [ ], m1[2,3], prendo l’elemento…