Lezione su RNA

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LEZIONE 7 25-28/10/19 SLIDE 10 SLIDE 13 RNA Dogma centrale della biologia molecolare il flusso dell'informazione genetica è monodirezionale: parte dagli acidi nucleici per arrivare alle proteine, senza considerare un percorso inverso TIPOLOGIE DI RNA: a. RNA transfer (t-RNA): serve nel meccanismo di appaiamento tra tripletta e AA; b. RNA ribosomiale (r-RNA): costituisce il ribosoma; c. Small nuclear RNA (sn-RNA) e small nucleolar RNA (snoRNA): RNA che lavorano nel nucleo o nel nucleolo e deputati a funzioni che hanno a che fare col processamento dell’RNA ribosomiale, delle molecole che servono allo splicing, al mantenimento dei telomeri (estremità dei cromosomi, associati ai processi di invecchiamento); d. RNA che interferiscono con la regolazione dell’espressione genica: 1. Small interfering RNA (si-RNA): si occupa di down-regolazione; 2. microRNA (mi-RNA); 3. long non-coding RNA (lnc-RNA): trascritto di almeno 200 basi che hanno funzione di down- regolazione in quanto interferiscono con l’azione di geni codificanti. Gli lncRNA possono essere: ▪ dispersi nel genoma, ▪ non inseriti nella struttura genica, ▪ in corrispondenza di un gene codificante: • nella variante esonica se ha la condivisione di un esone, • nella variante intronica quando il lnc-RNA è inserito nell’introne di un gene codificante, • oppure può contenere la sequenza genica. Banca dati per sequenze RNA = Rfam Per un data famiglia si può ottenere sia la struttura secondaria, che un grafico che rappresenta l’allineamento di diversi RNA; il rettangolo è il multiallineamento e gli archi sono le posizioni che sono dipendenti dal punto di vista statistico: è una rappresentazione del metodo di covarianza. MICRO-RNA: Sono i più studiati, sono già stati associati ad alcune funzion i: la regolazione e la…